故事从鲁邦三世与次元大介在一间法国乡村小镇公寓里的房间开始。网络上存在一个黑暗的网站「马可波罗」，在那里你可以买到任何非法的东西，如毒品和枪支。为了窃取数位货币，鲁邦入侵了一个严密的服务器设施，并且遇到一位天才黑客少女艾咪。接着鲁邦在「马可波罗」上被悬赏高额的奖金，而鲁邦跟艾咪要共同面对来自各方的杀手......

《鲁邦三世》第26作特别节目《鲁邦三世 再见搭档》，是时隔6年的完全原创电视特别节目。由秦建日子着手编剧，以“次元的背叛”为故事主题进行展开。围绕瞄准鲁邦性命的次元，以及决不允许同伴背叛而怒火中烧的五卫门。描绘了“史上最强的敌人”，次元与鲁邦、五卫门的对决。